Основная часть территории Тункинского национального парка принадлежит гидроминеральной области азотных, метановых и углекислых кремнистых термальных минеральных вод, а территория северной части, относительно небольшой площади, принадлежит Восточно-Саянской гидроминеральной области углекислых холодных и термальных минеральных вод.
К классу минеральных вод относят природные воды содержащие в повышенных концентрациях те или иные минеральные (реже органические) компоненты и газы, обладающие какими-либо специфическими свойствами, благодаря которым эти воды оказывают на организм человека лечебное воздействие.